Vigie-Chiro
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 ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]

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Yann T.

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MessageSujet: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyDim 2 Jan - 15:49

[Logiciel d’analyse acoustique gratuit, portable, en français sur les ordinateurs en français, sinon en anglais. Il suffit de télécharger le zip et de le décompresser en faisant un clic droit > "extraire ici" puis de double cliquer sur le fichier ChiroSurf (pas d’installation proprement dite)]

ChiroSurf 2.8: 18 novembre 2024 (dernière version): ChiroSurf2.8
Il suffit de télécharger le fichier zip avec le lien ci-dessus et, une fois sur le PC, de faire un clic droit «Extraire ici».
- Possibilité de faire des sélections de taxons (graphiques en points chauves-souris): voir image page 6 de ce post
- Réglage du filtre de la simulation hétérodyne (correction d'un bug).
- Clarification de la validation (message, repère), de l'interface (plus de personnalisation possible, gain de place), de la notice (notamment pour le mode Chiro / Auto, voir image page 6 de ce post, message du 14/11).
- Ajout d'un csv Tadarida test au zip pour ceux qui veulent voir les possibilités des graphiques.
- Les manuels mis à jour, le csv test et un fichier wav test sont disponibles via le logiciel lui-même (Liens/manuels et fichiers de test)

ChiroSurf 2.7: 14 octobre 2024:
- Correction et prévention de bugs liés aux graphiques.
- Accès à la clé sans avoir à afficher les graphiques.
- Amélioration de la fonction hétérodyne.
* Fonction « Audible forcé » (voir message du 14 10 en page 6 de ce post).
* Couplage Fichier+Note (idem).
- Présentation de Vigie Chiro dans le manuel.

ChiroSurf 2.6: 01 juillet 2024:
- Élargissement des groupes de taxons possibles pour la validation (Chirosp, Myosp pour les murins, Plesp pour les oreillards, Pipsp pour les pipistrelles et Rhisp pour les rhinolophes).
-  Ajustement du processus de validation Vigie Chiro lui-même, pour tirer profit des possibilités offertes par ChiroSurf.
- D’autres modifications facilitent la validation et clarifient le comportement des graphiques: voir les notices jointes au zip.

* Un post dédié aux graphiques et à la validation avec ChiroSurf reprend les informations des notices dédiées: Graphiques et validation avec ChiroSurf
* Un autre présente la clé simplifiée des FME réalisée à partir des données de Yves Bas: Clé des FME dans ChiroSurf

Page 2 du manuel:
ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros41

----------------------
ChiroSurf 2.5: 11 juin 2024
- Notices entièrement mises à jour (Manuel général, Validation, Graphiques)
- Intégration de la clé simplifiée des FME dans le logiciel
- Possibilité d’ajouter des documents personnalisés à cette clé
- Possibilité d’ajouter des documents personnalisés sur les taxons
- Changement automatique des mesures et échelles des axes aux domaines ultrasons / audible
- Amélioration de certains graphiques (graphique en points 2: comportement par rapport aux contacts validés / graphique de comparaison de plusieurs csv: les taxons intégrés n’étaient pas encore pris en compte, par exemple Myomyo Myobly et Myopun pour MyoGT)
- Quelques réglages visuels
- Prévention et correction de bugs éventuels. Deux exemples:
* les fichiers wav de type BWF, non pris en charge, provoquaient la fermeture du logiciel: à présent un message explicatif apparaît sur la marche à suivre (notamment les wav issus d’un zoom h2n et mélangeant expansion et hétérodyne)
* les fichiers aux noms trop longs provoquent une modification automatique du nom d’où un dysfonctionnement des boutons Suivant/Précédent: un message explicatif apparaît à présent. Une base de données récente propose ainsi des noms tellement longs qu’il suffit de les placer dans quelques sous-dossiers pour qu’ils dépassent la limite autorisée par Windows…

ChiroSurf 2.4: 24 avril 2024
ChiroSurf 2.3: 04 février 2024
Cette version permet entre autres d'utiliser ChiroSurf sur les réseaux d'entreprise fonctionnant avec Samba.
ChiroSurf 2.2: 01 janvier 2024
----------------------

Autres visuels du manuel général:

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros52

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros42

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros43

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros31

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros36

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros37

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros32

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros33

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros34

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros45

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Chiros51

2. Développement de ChiroSurf:

En juin 2021 j'ai commencé à développer le logiciel d'analyse des ultrasons ChiroSurf. Le but était d'abord d’avoir un logiciel pensé pour les participants à Vigie Chiro et adapté à une utilisation pédagogique (initiation à la bioacoustique et sensibilisation aux problématiques des sciences participatives en milieu scolaire), avec un mode de lecture des mesures moins usant pour les yeux que des logiciels comme Syrinx ou Batsound.

Cet objectif initial est atteint et le développement continue bien au-delà de ce qui était prévu, avec des fonctionnalités nouvelles et de plus en plus pointues. ChiroSurf permet à présent une exploitation des fichiers csv issus du traitement automatique Tadarida (Yves Bas, MNHN, CESCO) qui n'existait pas auparavant, quel que soit le protocole. Il est le seul logiciel à permettre une visualisation et une validation aisée des protocoles routier et pédestre, en plus du protocole point fixe. Outre l'analyse bioacoustique, le développement couplé à Tadarida est à la fois au service de la gestion de données, pour une exploitation scientifique, en même temps qu'il vise à permettre l'éveil de la curiosité du plus grand nombre sur la biodiversité qui l'entoure. ChiroSurf est de plus en plus utilisé par des bureaux d'étude autant que des associations ou des particuliers.

Le logiciel est bilingue (adaptation auto en anglais / français selon les paramètres de l'ordinateur), mais vise une adaptation auto pour les autres langues européennes.

Le développement de ce logiciel nécessite un travail très conséquent, à la fois en tant qu’amateur naturaliste passionné et pour une utilisation professionnelle en tant qu’enseignant. L’objectif est d’avoir un outil attractif et rigoureux au service d’actions passionnantes… Autrement dit, téléchargez, utilisez, diffusez, signalez-moi des soucis éventuels en mp.

Le code de ChiroSurf est pérenne: on peut le lire sur n’importe quelle version de Windows. Il est issu d’une refonte complète et d’un développement conséquent du code et des modalités de fonctionnement de WaveSurfer 1.8.5, logiciel libre remarquable créé en 2000 par Kåre Sjölander and Jonas Beskow pour leurs cours au département Speech, Music and Hearing d’une école de sciences de l’ingénieur du Royal Institute of Technology de Stockholm.



Dernière édition par Yann T. le Dim 24 Nov - 7:36, édité 139 fois

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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyLun 3 Jan - 9:55

Waouh ! Impressionnant travail, et le résultat en jette ! Effectivement la lecture de la LB serait un gros plus, et le deuxième la possibilité de passer au fichier suivant/précédant. Mais ça semble déjà très opérationnel, bravo !!
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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyVen 14 Jan - 7:32

On peut maintenant passer facilement aux fichiers précédent/suivant.

Ces deux points sont effectivement nécessaires pour être une alternative à Syrinx. C'est donc chose faite dans la version 1.1 pour changer de fichier (les liens ont été mis à jour): soit par les icônes, soit par les raccourcis clavier CTRL+L (précédent) et CTRL+M (suivant).

Pour mettre à jour il suffit de remplacer par la nouvelle version (fichier du même nom, ChiroSurf, via le lien du premier message) et de modifier le nom du dossier 1.0 en 1.1 dans le dossier "Ce PC > OS (C:) > Utilisateurs > Nom > .chirosurf"

Merci pour le message précédent Wink

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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyDim 3 Avr - 16:10

YEP, ça m'a l'air très bon tout ça ! Je quasi-débute, et je vais tester ça en parallèle de Syrinx, mais ChiroSurf m'a l'air déjà plus "ergonomique" !
Je n'y connais absolument rien en dev / prog alors ne pas s'offusquer de ma question : serait-ce compliqué de faire une version qui tourne sur Android ? L'utilisation d'une tablette me parait plus simple pour gérer l'analyse en "quasi-direct", et c'est un outil plus facile à protéger de l'humidité qu'un ordi...mais je me dis qu'il faut refondre le code, non ?
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Yann T.

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MessageSujet: Attends un peu ;)   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyLun 4 Avr - 18:34

Bonjour,

Merci de l'intérêt pour ChiroSurf.

Attends un peu, je mets en ligne dimanche une version 1.2 qui corrige quelques bugs pour certains échantillonnages, ajoute la lecture des MP3, une vue globale du fichier et, surtout, un curseur horizontal avec une petite fenêtre indiquant clairement la fréquence. Ce sera plus facile à utiliser.

Par ailleurs, il manquera encore la lecture directe de la largeur de bande comme dans Syrinx.

Pour une version android, c'est possible, mais, d'une part, il faut que ChiroSurf soit complet pour PC (ce n'est pas encore le cas, voir ci-dessus), pour Mac, et certaines fonctionnalités sont pratiques à la souris: un clic molette pour dézoomer par exemple. Ce ne sera pas pour tout de suite...
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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyLun 4 Avr - 18:41

Bonjour,

Ok, merci pour la réponse : je vais suivre ça avec intérêt !

A bientôt
Hervé
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Yann T.

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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyDim 10 Avr - 22:40



Les précisions ci-dessous concernent une version ancienne de ChiroSurf qui a évolué depuis (voir le premier post édité à chaque nouvelle version)

Nouveautés de la version 1.2 :

Au-delà de diverses améliorations – entre autres, lecture des MP3, corrections de bugs pour certains échantillonnages, simplification de la procédure pour créer une configuration personnalisée ou pour choisir la configuration par défaut – la version 1.2 apporte quatre changements importants :

1- Curseur horizontal avec fenêtre de fréquence :

En plus de la ligne verticale de temps, une ligne horizontale de fréquence donne maintenant en permanence dans le sonagramme la valeur de la fréquence affichée dans une petite fenêtre qui suit le curseur de la souris.

Si la fenêtre de spectre est ouverte, ce curseur horizontal du sonagramme se coordonne avec le curseur vertical de fréquence du spectre (et vice versa).

Quand le curseur horizontal d’amplitude du spectre se cale sur le max en décibel, le curseur horizontal du sonagramme et le curseur vertical du spectre se mettent pile sur la FME que l’on peut lire à la fois dans la fenêtre de spectre et sur le sonagramme.

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Uc?id=1_iLT0D6scbi2_2Fo41NXLjrphzYGR8QT

2- Configurations sombres (paramétrables comme les autres) :

On peut voir un exemple de la config Dark-1600x900 au premier message.

3- Vue globale :

Une vue globale de toute la durée du fichier permet maintenant de mieux se repérer. C’est la vue qui se lance à l’ouverture d’un fichier.

Elle est accessible par l’icône « double flèche horizontale » et le raccourci « Flèche gauche » ou encore un clic molette. La vue x15 de référence est accessible par l’icône dédiée, le raccourci « Flèche droite » ou encore un double clic.

4- Maintien de la fenêtre d’affichage de durée :

La petite fenêtre d’affichage de la durée mesurée disparaît seulement au clic suivant, permettant ainsi de lire en même temps les mesures de durée et de fréquence sans ouvrir la fenêtre de spectre.



Dernière édition par Yann Trévilly le Mar 20 Sep - 21:16, édité 2 fois

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Yves Bas
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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyLun 11 Avr - 16:11

Génial !!!
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Yves Bas
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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptySam 16 Avr - 8:01

Bonjour,
Vraiment super cet outil ! De mon point de vue, il reste 2 petits défauts qui rendent son utilisation moins pratique que Syrinx pour un-e utilisateur-rice "intensif-ve" :
- l'échelle de luminosité semble dépendre du maximum d'amplitude au cours du fichier, du coup le bruit de fond "saute" de blanc à gris selon qu'on ait ou non un cri fort dans plusieurs fichiers consécutifs. Une échelle fixe et non relative serait à mon avis plus pratique quand on analyse plusieurs fichiers venant de la même source, et particulièrement plusieurs fichiers de la même séquence de chauves-souris
- en échelle <1> , je préfererai qu'on garde la même échelle de temps même si le fichier dure moins de 5 secondes. Là, quand on passe par exemple d'un fichier de 5 secondes à un fichier de 1 seconde, la visualisation du rythme s'en trouve perturbée à première vue.
Mais bon, je suis conscient que c'est de la pinaille ^^, je sens que c'est tellement proche de la perfection que je ne peux m'empêcher d'exprimer ces petites frustrations ;-)
Encore un grand bravo !!
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Yann T.

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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyMer 20 Avr - 19:14


Merci ! Wink

Les précisions ci-dessous concernent une version ancienne de ChiroSurf qui a évolué depuis (voir le premier post édité à chaque nouvelle version)

- amélioration des deux principaux visuels qui étaient un peu trop saturés, les contours des signaux sont plus nets.
- simplification des procédures de configuration qui sont également mieux expliquées dans le manuel.
- correction d’un bug sur les ordis paramétrés dans une langue autre que le français à cause du processus de traduction auto du logiciel en anglais.
- correction d’un bug mineur lors du processus d’application d’une configuration provisoire.

Les problèmes ci-dessous sont réglés à présent

Pour le réglage de la saturation c’est compliqué : en fait on peut très bien paramétrer le code pour que la vue soit élaborée une fois pour toute : c’est très agréable, mais dans ce cas les autres opérations deviennent trop lourdes et ça plante. Plus exactement Windows impose une limite de 32767 pixels pour les graphiques et c'est atteint dès la vue 20 sur un écran classique.

Pour garder de la fluidité et éviter les plantages, le visuel est recréé à chaque mouvement de sorte à être dimensionné à largeur de l’écran. Effectivement ça provoque… C’est réglé à présent.

Pour l’autre point je n’ai pas bien compris, a priori l’échelle est la même., je pense avoir compris que ce sont les intervalles qui apparaissent ou non selon la vue qui peuvent gêner, pour certains modes d’utilisation du logiciel. J’ai mis en ligne ce matin une mise à jour avec un choix supplémentaire pour l’axe temporel : le mode « Tfix » n’affiche que les secondes, quelle que soit la vue.  Les demi-secondes poseraient problème en vue 1 sur les écrans classiques.

Pour choisir ce réglage : clic droit sur l’axe temporel, « Réglages de ce panneau... », « Format de temps de l’axe », « Tfix », « Ok » puis sauvegarder la config (clic droit « Sauvegarder la configuration ») et la choisir comme config par défaut dans les paramètres : elle sera effective à l’ouverture du prochain fichier.

J’en ai profité pour corriger également le choix de l’axe en ms.



Dernière édition par Yann Trévilly le Mar 20 Sep - 21:17, édité 2 fois

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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyJeu 21 Avr - 15:01



Finalement j’ai mis le même réglage pour le choix « T/10 » de l’axe temporel, celui qui indique les durées réelles des signaux. En vue 1 ça démarre à 0,1 0,2 seconde, donc par intervalles de 100 ms qui restent fixes dans les vues suivantes.

Tfix : Temps du fichier (fichier de 50s = échelle sur 50s), échelle fixe en secondes entières.
T(s) : Temps du fichier, échelle dynamique avec intervalles plus précis selon la vue et l’écran.
T/10 : Temps du signal (fichier de 50s = échelle sur 5s), échelle fixe avec intervalles de 0,1 seconde.
ms : Temps du signal en ms (fichier de 50s = échelle de 0 à 5000ms), échelle dynamique.



Dernière édition par Yann Trévilly le Mar 20 Sep - 21:19, édité 1 fois
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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyMer 4 Mai - 15:48

Salut,

=> P'tite question d'un novice... Serait-il possible d'intégrer une sorte de "d'annotation des mesures" ?

=> Je m'explique...
-sur un cri, on positionne la souris une fréquance donnée (disons 19,6 KHz)
-clic droit > ça nous propose "FI" "FT" "FME" etc.
-on choisit "FI" et ça nous mets la fréquence dans un bloc-note (FI=19.6 KHz)
-on fait pareil pour les autres mesures (FT, FME, ...) qui s'inscriront sur le bloc-note

Ça me paraitrait utile pour réaliser toutes les mesures à la volée sans avoir à les recopier. Resterait ensuite à les copier/coller d'un coup du bloc-note vers un tableur.

Je ne sais pas ce que ça vaut, je ne suis qu'un débutant...
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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyMer 4 Mai - 18:48

Bonjour,

Merci pour les propositions. Pour l'instant ce n'est pas à l'ordre du jour, mais c'est intéressant. ChiroSurf est destiné à être petit à petit au point pour une méthode d'analyse qui ne passe pas forcément par des nuages de points en entrant des mesures. Néanmoins, je retiens l'idée.
Sinon j'ai finalisé une mise à jour pour le choix entre luminosité absolue et relative au changement de fichier, mais j'attends d'aboutir à une autre évolution avant de la mettre en ligne. J'en profite pour présenter mes excuses: il y a une dizaine de jours j'ai mis en ligne, une journée, une version avec un bug de luminosité, et je mets en place des garde-fous pour éviter toute nouvelle bévue.

Yves Bas aime ce message

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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyDim 8 Mai - 23:12

Ok, super.
Concernant l'annotation, c'est une possibilité que présente Audacity et que j'utilise pour l'analyse des cris d'oiseaux, soit pour mémoriser largeur de bande et durée d'un cri (alimentation d'une base de données pour une IA de détection auto => projet NBM), soit pour lister simplement les espèces et les horaires de passage de chaque piaf sur un enregistrement nocturne.
Quoi qu'il en soit, impatient de voir la suite !
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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyDim 19 Juin - 16:31

Salut,

Petits soucis, sans doute liés à mon inexpérience en acoustique informatique...
=> Je viens de recevoir un micro USB Dodotronic Ultramic 384K evo, que j'utilise avec l'appli BatRecorder sur un smartphone. Pas de souci en écoute active et enregistrement : je vois bien les cris, ils s'enregistrent correctement et je peux les relire sur le téléphone sans pb.

=> Mais quand j'importe ces enregistrement sur ChiroSurf, les cris ne sont pas visibles...Bizarrement, ils apparaissent bien sur l'oscillo, mais rien sur le sonogramme :
image enlevée car pb réglé, voir plus bas

=> Avec Audacity, pas de souci, je les vois (screen réalisé sur le même enr. au même temps) :
image enlevée car pb réglé, voir plus bas

=> Avant, avec des enr. issus d'un ActiveRecorder (en expension de temps), il n'y avait pas de pb...qques chose m'échappe et j'ai beau bidouiller... Ça me fait pareil avec Syrinx...


Dernière édition par Hervé Renaudineau le Mar 12 Juil - 10:39, édité 1 fois
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P. GERSON

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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyLun 20 Juin - 13:41

Bonjour,
Réflexion rapide.
Le fichier disponible dans l'appli bat recorder est .wav,mono,384 khz,32bits.
Mais s'agit il d'un temps réel (full time), un FD (division de fréquence),TE(extension de temps) ?
Je viens de parcourir la notice ,je pense que c'est de la FT.
chirosurf demande des fichiers wav en TE.
Syrinx des fichiers wav en direct ou TE.
Donc il faut faire quelques conversions...
A creuser. Il serait intéressant de mettre a disposition  un tel fichier pour faire avancer la constellation  CHIRO.
Patrick.
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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyLun 20 Juin - 20:40

@Patrick : merci pour ta réponse !


Dernière édition par Hervé Renaudineau le Mar 12 Juil - 10:40, édité 1 fois
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P. GERSON

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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyJeu 23 Juin - 9:25

Bonjour Hervé,
je te suggère de demander aux administrateurs qu'a partir de ton message du  19/06/22 16:31 ,ces messages soient déplacés en un sujet spécifique. comme:Les fichiers recueillis sur l'appli BatRecorder "ou"Passer de la prise de son à l'analyse logicielle".....
ce qui permettra de lancer un vrai sujet
et a Yann T de pouvoir conserver son sujet consacré a son  développement de CHIROSURF.

***Pour mettre un lien : Fichier wav pour accompagner un post.

Pouvoir exploiter ses enregistrements n'est pas aisé!!
Il faut savoir ce que fourni le matériel origine.le Super Micro
La question est plus la nature de ce que je vais enregistrer (son direct, division de temps, extension de temps, hétérodyne.)

les éléments suivants .wav,mono,384 khz,32bits sont plus à qualifier de moyen de transport.
je ne pense pas que c'est ces valeurs a priori qu'il faut manipuler et qui posent problème dans ce cas.

Et ce que le logiciel d'analyse est en mesure de digérer. là, c'est plus la nature qui je pense est le point à mettre en phase.

d'où l'utilisation de quelques outils (fourni avec ton appareil par le constructeur, ou autre:  kaleidoscope,...) et surtout faire des transformations sur un paramètre précis  et les minimiser .
Avec la communication d'un spécimen de tes fichiers et un sujet spécifique, les avis vont affluer What a Face
Patrick.
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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyDim 26 Juin - 10:00

=> Effectivement, ces posts polluent le fil initial, et je me rends compte que j'aurai gagné à consulter plus largement le forum avant de poser mon pb...
=> J'ai donc trouvé la solution : les fichiers issus de BatRecorder sont bien en Full Time, et il suffit de les convertir en Exp. de temps x10 grâce par ex à Kaleidoscope (pas réussi à le faire avec Audacity, quelque chose m'échappe...), en suivant les réglages proposés par le tuto "protocole routier" de Vigie-Chiro.
=> En gros, 'suffisait de chercher...

Merci en tout cas ! Ça m'a permis d'y voir un peu plus clair, mais aussi de trouver comment gérer sur Audacity un fichier en Full Time pour le lire en Exp de temps + faire des mesures + afficher la densité spectrale. Ce n'était pas le but, mais c'est utile !
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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyVen 8 Juil - 10:09

Bonjour,

Petit retour concernant ChiroSurf.

=> Prise en main simple et rapide, ensemble très ergonomique, fichiers d'aide très bien faits >>> BRAVO ! C'est déjà un outils qui permet à un débutant comme moi une entrée plus facile dans "le côté acoustique de la force".

=> Quelques idées en vrac :
-ouvrir l'explorateur de fichiers sur le dernier dossier ouvert et/ou prédéfinir soi-même le dossier qui sera ouvert
-ajouter un bouton "Supprimer" afin d'éviter de devoir retourner dans le dossier pour supp un fichier
-barre de contrôle de la saturation : mettre un petit repère au milieu
-quand on sélectionne, faire en sorte que l'écran suive si la souris veut "sortir" de l'écran (mesure d'intervalles par ex)
-possibilité d'annoter les fichiers + export des notes

Super boulot en tout cas !
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Yann T.

Yann T.


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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyDim 10 Juil - 18:03

Bonjour,

Apparemment pour recevoir les notifications de message concernant son propre fil, il faut l'inscrire comme fil suivi (c’est fait), sinon on ne reçoit une notification qu’au  premier message d'un participant, et pas ses suivants.

Merci Hervé d’avoir enlevé les images et la digression qui brouillaient ce fil. Le but est de présenter, petit à petit et de façon pas trop dispersée, l’évolution du logiciel, avec un rythme très tranquille car je ne suis pas programmeur et ce n’est pas simple.

Néanmoins, l'ouverture de fichiers bruts enregistrés avec des taux d'échantillonnage destinés au traitement des ultrasons aurait dû être anticipée. J'ai donc modifié le code de sorte que l'affichage de tels fichiers bruts soit plus correct.

Le plus est que j'en ai profité pour adapter automatiquement ChiroSurf aux taux 44100hz et 48000hz, par exemple pour l'ornithologie, avec un doute sur d'autres échantillonnages possiblement utilisés en ornithologie. Si un fichier avec ces échantillonnages est ouvert, les échelles des axes et des mesures sont automatiquement modifiées. Voir ce que cela donne pour un rouge-gorge au post 1 de ce fil...



Dernière édition par Yann Trévilly le Mar 20 Sep - 21:23, édité 6 fois
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Yann T.

Yann T.


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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyDim 10 Juil - 18:08

Réponse au deuxième message:

Avant de répondre point par point en reprenant chacune des propositions, voici les priorités sur lesquelles l'effort est porté:

Les précisions ci-dessous concernent une version ancienne de ChiroSurf qui a évolué depuis (voir le premier post édité à chaque nouvelle version)

* Toutes les vues (et leur FFT) fonctionnelles quelle que soit la durée des fichiers. Par exemple un fichier de 3 secondes en vue 1 s’affichera sur 50 secondes (3 secondes de signaux suivies d’un silence de 47 secondes), et pourra ainsi bénéficier de la FFT 2048 des vues 1 et 2 : voir la formation Rhinolophes du 22 janvier 2022 pour savoir pourquoi c'est utile.

* Stabilisation de la luminosité lors du parcours du fichier à la molette (là c'est pas gagné, c'est ce qui retarde la mise en ligne de la version 1.3 depuis plusieurs semaines problème réglé depuis...).


Pour les propositions:

« -ouvrir l'explorateur de fichiers sur le dernier dossier ouvert et/ou prédéfinir soi-même le dossier qui sera ouvert. »

ChiroSurf est portable et ouvre d'abord le dossier dans lequel il est lui-même situé: si l'on veut on peut simplement copier-coller le logiciel dans le dossier où l'on place les fichiers, sans aucune installation. C'est ce fonctionnement qui va perdurer. On peut aussi le laisser dans un dossier dédié où l’on place les dossiers de fichiers que l'on veut traiter, ainsi faciles à atteindre à l’ouverture du premier fichier.

Une fois un fichier ouvert, au changement de fichier le logiciel ouvre le dossier en cours (on copie-colle le nom du fichier depuis le csv ou Shiny, avec l’affichage des noms de fichiers paramétré pour cacher l’extension).

« -ajouter un bouton "Supprimer" afin d'éviter de devoir retourner dans le dossier pour supp un fichier »

Le mieux est de ne pas supprimer des fichiers au cours d’une analyse, d’autant qu’un faisceau d’indices peut être réparti sur plusieurs fichiers. Cette fonction ne sera pas ajoutée: ChiroSurf n'est pas un logiciel de gestion de fichiers, et tout ce qui risque de causer un souci de perte ou d'altération de fichier a été évité, le logiciel étant aussi utilisé en partie dans un cadre scolaire avec des élèves du secondaire.

Si vraiment on fonctionne de cette manière, alors il est préférable de travailler directement à partir du dossier dans lequel sont les fichiers, ouvert en plein écran: on gère l’emplacement et le redimensionnement /plein écran de ChiroSurf comme n'importe quelle fenêtre, on ouvre les fichiers par glisser-déposer et on les supprime directement dans le dossier ouvert.

« -barre de contrôle de la saturation : mettre un petit repère au milieu »

Les précisions ci-dessous concernent une version ancienne de ChiroSurf qui a évolué depuis (voir le premier post édité à chaque nouvelle version) : c’est réglé à présent avec un chiffrage précis de la valeur de la luminosité. Ce ne serait pas utile puisque la barre se remet toute seule à 0 au changement de fichier. Dans la prochaine version on aura le choix entre revenir à 0 ou rester au même réglage d’un fichier à l’autre. Le 0 de ce système est très relatif, il se fait à partir de l'intensité sonore la plus basse du segment à l'écran, ce qui change à chaque fichier et malheureusement dès qu'on se déplace dans le fichier (ce n’est plus le cas depuis la version 1.4). C’est donc le visuel obtenu qui doit guider le réglage.

« -quand on sélectionne, faire en sorte que l'écran suive si la souris veut "sortir" de l'écran (mesure d'intervalles par ex) »

Ce n'est pas utile, il faut d'abord se déplacer dans le fichier à la molette (ou changer de vue) pour afficher correctement ce que l'on a repéré et donc ce que l’on a choisi de mesurer, et non pas chercher à mesurer ce que l'on ne voit pas encore. Ce serait même fastidieux.

« -possibilité d'annoter les fichiers + export des notes »

C'est pas mal comme idée. Mais on verra bien plus tard, surtout que je ne sais pas encore comment faire Wink C’est fait à présent avec des notes auto txt et csv, voir le premier post édité


Dernière édition par Yann Trévilly le Mar 20 Sep - 21:24, édité 1 fois
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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyMar 12 Juil - 11:00

Bonjour,

=> Bien noté tes réponses et ok avec l'ensemble, merci ! Juste 2 points que je me permets de commenter pour préciser ma pensée :

« -barre de contrôle de la saturation : mettre un petit repère au milieu »

Le but serait juste d'avoir un repère pour revenir plus facilement vers un réglage donné lors de l'analyse d'un même fichier. Mais c'est du chipotage...

« -quand on sélectionne, faire en sorte que l'écran suive si la souris veut "sortir" de l'écran (mesure d'intervalles par ex) »

C'est un réflexe qui me vient d'Audacity, et que j'ai lorsque je mesure plusieurs intervalles à la suite : je vais essayer une autre routine.

« -possibilité d'annoter les fichiers + export des notes »

Audacity le permet : s'il y a des points communs avec ChiroSurf en terme de code, ça peut être utile de regarder ?

=> Je n'ai pas de compétences en prog, mais si tu as besoin de faire des batteries de tests, de quelqu'un pour faire de la mise en forme (tuto, docs d'aide, ...), ou autre chose, n'hésite pas à demander, je peux me dégager du temps.
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Hervé Renaudineau




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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyMar 12 Juil - 11:01

Bonjour,

=> Bien noté tes réponses et ok avec l'ensemble, merci ! Juste 2 points que je me permets de commenter pour préciser ma pensée :

« -barre de contrôle de la saturation : mettre un petit repère au milieu »

Le but serait juste d'avoir un repère (voire un index numérique) pour revenir plus facilement vers un réglage donné lors de l'analyse d'un même fichier. Mais c'est du chipotage...

« -quand on sélectionne, faire en sorte que l'écran suive si la souris veut "sortir" de l'écran (mesure d'intervalles par ex) »

C'est un réflexe qui me vient d'Audacity, et que j'ai lorsque je mesure plusieurs intervalles à la suite : je vais essayer une autre routine.

« -possibilité d'annoter les fichiers + export des notes »

Audacity le permet : s'il y a des points communs avec ChiroSurf en terme de code, ça peut être utile de regarder ?

=> Je n'ai pas de compétences en prog, mais si tu as besoin de faire des batteries de tests, de quelqu'un pour faire de la mise en forme (tuto, docs d'aide, ...), ou autre chose, n'hésite pas à demander, je peux me dégager du temps.
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Yann T.

Yann T.


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MessageSujet: ChiroSurf Version 1.2.3   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] EmptyDim 17 Juil - 4:45

 Hervé, ci-dessous une version avec des évolutions, dont l’indication de luminosité et la prise de notes.

Audacity, que j’ai tenté de modifier pendant quelques mois par curiosité mais sans les compétences nécessaires, et ChiroSurf, ont des codes très différents. Audacity, dont le code ne peut en rien éclairer celui de ChiroSurf, est multilangage (de programmation) et complexe, alors que ChiroSurf est du pur TCL, plus simple.

Il est possible de télécharger ici une version avec des évolutions

- Toutes les vues fonctionnelles, quelle que soit la longueur des fichiers.
- Adaptation auto des échelles (axes et mesures) en fonction de l’échantillonnage pour passer de fichiers sans division de fréquence ni expansion de temps (44100 et 48000) à des fichiers traités.
- Fenêtre d’indication chiffrée de la luminosité, de -100 à 100 :

ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Uc?id=1QOPSmZXRwT4um0JWUjCge2VKCF9VXEjw

- Luminosité relative / absolue (peu utile en l’état, c’est réglé depuis et c’est bien utile...). Le signe « 0 » à droite de la barre de réglage de la luminosité signifie que celle-ci est remise à « 0 » au changement de fichier. Si on clique dessus le « 0 » se transforme en « = », ce qui signifie que le réglage de luminosité est maintenu au changement de fichier.

J’ai mis « 0 » par défaut. Pour des fichiers chiro en division de fréquence et expansion, le réglage « = » est pour l’instant inutile car la luminosité varie trop au sein même d’un fichier C’est réglé depuis la version 1.4.

- Prise de notes : au clic droit deux commandes supplémentaires sont proposées :
* « Ouvrir une note... » pour ouvrir une note texte déjà créée (ouvre d’abord le dossier où se trouve ChiroSurf).
* « Créer une note... » : ouvre une interface qui propose d’enregistrer un fichier texte dont il faut créer le nom. Quand on clique sur « enregistrer » un fichier texte est créé (dans le dossier où se trouve ChiroSurf) et s’ouvre automatiquement avec quelques infos pré-remplies.

Voir les images éditées du post 1 pour des exemples.

- Corrections de plusieurs bugs, par exemple le format d’affichage des durées mesurées de 1ms.

Si on garde des configurations perso, mise à jour nécessaire du sonagramme :

Tant que la config utilisée est obsolète, la mise à jour est proposée au clic droit sur le sonagramme (« Mettre à jour le sonagramme ») et se réalise juste en cliquant sur « ok » puis sur « Enregistrer » la configuration avec le même nom pour remplacer sa version obsolète… Le plus simple, si l’on souhaite conserver une ancienne config, est de refaire la config selon son écran en notant simplement la hauteur des panneaux des anciennes configs.



Dernière édition par Yann Trévilly le Mar 20 Sep - 21:27, édité 2 fois

Yves Bas, P. GERSON et Hervé Renaudineau aiment ce message

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MessageSujet: Re: ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24]   ChiroSurf 2.8, analyse bioacoustique, gratuit, portable [18 11 24] Empty

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